掌握機密情報的安東尼奧泰勒博士遭人綁架,因此美國總統專屬特務里昂奉命前往拯救,卻被一名神秘女子阻止而令行動失敗。另一方面,三藩市發生了感染途徑不明的喪屍疫情,生化恐怖主義安全評估聯盟「BSAA」的克里斯和吉兒前往調查此事。在克蕾兒所屬的非政府組織「諦拉席芙」的合作調查之下,「BSAA」顧問蕾貝卡從被沖上海灘的虎鯨屍體上的咬痕中檢測出T-Virus,經調查後發現所有變成喪屍的受害者都去過曾經作為監獄的阿爾卡特拉斯島。一行人因此乘搭渡輪前往監獄島調查並發現了重大陰謀…
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